Najwcześniejsze wzmianki w dokumentach dotyczących wsi w gminie pochodzą z 1136 r. z okazji powołania przez księcia głogowskiego Henryka II powiatu ponieckiego. Wówczas wymienione zostały: Bobkowice, Siedlec, Krzekotwice, Pasierbice i Wilkonice.
Do 1800 roku były to Bobkowice, ale widocznie honor mieszkańców ucierpiał na skojarzeniach, więc nazwa uległa uszlachetnieniu. Nazwy miejscowości pochodzą od imion i nazwisk osadników (np. Bobek - Bobkowice)
Adres strony internetowej Babkowic przygotowanej przez Dominika Szczęsnego : http://babkowice.w.interia.pl/